Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC093523.1-201ENST00000503268 499 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC078962.4-201ENST00000546135 254 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SSX1Q16384 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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SSX1Q16384 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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SSX1Q16384 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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SSX1Q16384 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
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SSX1Q16384 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SSX1Q16384 MIR3944-201ENST00000581277 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
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