Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.74
PTPRRQ15256 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC022034.3-201ENST00000471393 478 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 SEPT14P4-201ENST00000513445 186 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 KCNT2-206ENST00000609185 3622 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC016065.2-201ENST00000514530 444 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC020910.2-201ENST00000603635 610 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
PTPRRQ15256 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms