Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC026422.1-201ENST00000623961 452 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC106744.2-201ENST00000513955 898 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC013417.1-201ENST00000549896 271 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 ADPRM-204ENST00000609540 1138 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
HERC3Q15034 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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