Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 LINC01109-201ENST00000603837 3081 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RN7SKP100-201ENST00000411258 284 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
NCAPHQ15003 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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