Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AL442163.1-201ENST00000557251 515 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AL159169.2-201ENST00000610061 1269 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
SHPRHQ149N8 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SHPRHQ149N8 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
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