Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AL356489.2-201ENST00000566968 3528 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 PLCH1-201ENST00000334686 6128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
COL9A2Q14055 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
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