Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.81
CKAP5Q14008 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL139317.3-202ENST00000555689 528 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 LARP7P1-201ENST00000605576 316 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CKAP5Q14008 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.3 ms