Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC090897.3-201ENST00000636973 1157 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL034374.1-201ENST00000406329 351 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CACNA1CQ13936 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MTND4LP21-201ENST00000415303 295 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 SNRPGP9-201ENST00000456025 225 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 GYPA-203ENST00000503627 318 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC117532.1-201ENST00000514638 323 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CACNA1CQ13936 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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