Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 WFDC9-201ENST00000326000 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC025449.1-201ENST00000603896 529 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 PEX3-201ENST00000367591 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RPL23AP52-201ENST00000439311 478 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC021146.1-201ENST00000511202 716 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC046134.1-201ENST00000514454 666 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 GPR171-201ENST00000309180 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
TUBB3Q13509 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms