Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 CORIN-201ENST00000273857 4852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 SSR1-201ENST00000244763 9669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 XRCC5-201ENST00000392132 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 BTN3A2-201ENST00000356386 3017 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 OR11G2-203ENST00000641879 4415 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 LINC00598-211ENST00000636621 3241 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 KIAA2012-205ENST00000541917 3543 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 FZD3-204ENST00000537916 13740 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 PTPN14-201ENST00000366956 12985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 OR2A2-201ENST00000408979 1051 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 PPIAL4A-201ENST00000577856 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 SNORD96A-201ENST00000606577 79 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 EPHA3-201ENST00000336596 5809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 STIL-201ENST00000337817 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 CARD8-202ENST00000391898 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 NOL8-221ENST00000542053 3393 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 ZMYM2-210ENST00000610343 10200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 PROM1-219ENST00000539194 3884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 NEMP2-202ENST00000409150 6168 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 MDM4-205ENST00000391947 10008 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AC020658.2-201ENST00000559030 4020 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 FBXO43-201ENST00000428847 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 MID1-202ENST00000380779 6044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 TRG-AS1-201ENST00000629357 3645 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AC084816.1-201ENST00000413794 565 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AL390198.2-201ENST00000510553 222 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 SNORA74.1-201ENST00000516320 180 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AC009145.2-201ENST00000562685 377 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 ZNF528-201ENST00000360465 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 LINC01441-201ENST00000433766 2290 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 ZNF561-204ENST00000424629 4419 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 WASHC4-214ENST00000620430 5807 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
MKRN4PQ13434 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms