Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 RNU6-548P-201ENST00000517083 115 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 ATP13A5-205ENST00000620313 709 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SRSF6Q13247 LINC01625-201ENST00000454788 1690 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 MTCO1P31-201ENST00000506355 492 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SRSF6Q13247 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms