Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RPS25P9-201ENST00000435591 252 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC099566.1-212ENST00000451675 799 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC099566.1-205ENST00000609411 657 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RPA4Q13156 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms