Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
NFIAQ12857 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 MIR1193-201ENST00000408109 78 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 U51244.1-201ENST00000423120 374 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL355810.1-201ENST00000614629 552 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 MOXD1-201ENST00000336749 2950 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RN7SKP222-201ENST00000410651 315 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RNU2-6P-201ENST00000411404 190 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
NFIAQ12857 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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