Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CTIFO43310 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CTIFO43310 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CTIFO43310 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CTIFO43310 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CTIFO43310 KCNJ16-203ENST00000392671 3981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CTIFO43310 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CTIFO43310 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CTIFO43310 CUL3-216ENST00000617432 1426 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CTIFO43310 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CTIFO43310 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AL845331.3-202ENST00000562856 261 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
CTIFO43310 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
CTIFO43310 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
CTIFO43310 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
CTIFO43310 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CTIFO43310 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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