Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC074327.1-201ENST00000448017 540 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC107072.2-201ENST00000452412 555 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RNU4ATAC3P-201ENST00000516699 126 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
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HOXD1Q9GZZ0 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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HOXD1Q9GZZ0 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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HOXD1Q9GZZ0 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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HOXD1Q9GZZ0 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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HOXD1Q9GZZ0 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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HOXD1Q9GZZ0 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 AL590229.1-201ENST00000603497 542 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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