Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 CABYR-216ENST00000621648 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 AL158835.1-203ENST00000415305 3149 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 CEACAM1-207ENST00000403444 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 PCBP1-AS1-210ENST00000416395 2451 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 MT1A-201ENST00000290705 396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 RNU1-74P-201ENST00000384108 171 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 RPL10P7-201ENST00000495649 625 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 KC877392.1-201ENST00000524855 426 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 DSG1-AS1-202ENST00000578477 588 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 SNORA70D-201ENST00000578836 135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 FAM13C-219ENST00000621119 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 OR5A2-201ENST00000302040 6318 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 SAMD3-203ENST00000437477 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 ZC3H11A-201ENST00000332127 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 ALG10-201ENST00000266483 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 ZNF337-202ENST00000376436 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 AL136531.3-201ENST00000624378 3658 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 LRMP-204ENST00000547044 2208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 RNA5SP512-201ENST00000364550 120 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 TRAJ46-201ENST00000390491 63 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 FREM2-AS1-201ENST00000448887 465 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 RN7SL32P-201ENST00000580514 281 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 AC011516.1-201ENST00000599129 180 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 LINC01002-204ENST00000631644 473 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 ZNF121-202ENST00000586602 7177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 GJC1-207ENST00000590758 7566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 ADH1B-201ENST00000305046 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
PHF12Q96QT6 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms