Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 ATP2B1-202ENST00000359142 6977 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AL590432.1-201ENST00000420071 566 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 CALM1P1-201ENST00000442082 433 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC1.53□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 RFPL1S-203ENST00000539579 330 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SMG1Q96Q15 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
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