Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 OR51A3P-201ENST00000413596 924 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 ACAP2-IT1-201ENST00000419899 690 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC005189.1-201ENST00000431286 310 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 TRIM60P13-201ENST00000432350 1283 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 OR5T3-201ENST00000303059 1023 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 MTND3P20-201ENST00000407663 186 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC090753.1-201ENST00000522087 331 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC2.9□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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ZBED3Q96IU2 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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