Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 NIFKP6-201ENST00000598115 845 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 CYP3A51P-201ENST00000633513 256 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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KNOP1Q1ED39 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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KNOP1Q1ED39 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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KNOP1Q1ED39 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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KNOP1Q1ED39 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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KNOP1Q1ED39 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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KNOP1Q1ED39 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 PGRMC2-204ENST00000503872 1028 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
KNOP1Q1ED39 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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