Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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PTPRNQ16849 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
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PTPRNQ16849 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
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PTPRNQ16849 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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PTPRNQ16849 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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PTPRNQ16849 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 KIF27-204ENST00000413982 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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PTPRNQ16849 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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PTPRNQ16849 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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PTPRNQ16849 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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PTPRNQ16849 AC007458.1-201ENST00000542812 373 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 RABGAP1L-208ENST00000392064 6282 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PTPRNQ16849 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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