Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RPL17P50-201ENST00000396131 546 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
GABRA6Q16445 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 ZDHHC20P2-201ENST00000424108 429 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 PRKACB-218ENST00000610703 4240 ntTSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC011330.2-201ENST00000621680 635 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.55□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC092634.2-201ENST00000428146 1010 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
GABRA6Q16445 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.3 ms