Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AC087312.1-201ENST00000471411 480 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RPL9P33-201ENST00000484311 566 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
CCDC6Q16204 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 IGKV1OR2-6-201ENST00000603485 277 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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CCDC6Q16204 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CCDC6Q16204 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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