Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 C1orf146-201ENST00000370373 871 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SNCBQ16143 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AP000926.3-201ENST00000497201 299 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SNCBQ16143 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms