Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SYNE2-204ENST00000358025 21842 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC123912.3-201ENST00000600907 1367 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RNA5SP296-201ENST00000410523 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 LINC02472-201ENST00000512268 575 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 EIF2S2P4-201ENST00000461070 984 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
HERC1Q15751 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
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