Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC4.21□□□□□ -1.73
BRD3Q15059 PLPPR4-201ENST00000370184 4505 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC099566.1-211ENST00000595188 737 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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BRD3Q15059 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
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BRD3Q15059 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
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BRD3Q15059 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 CU459211.1-201ENST00000635667 749 ntBASIC4.2□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC4.2□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC4.2□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.2□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 MIR1302-8-201ENST00000408342 128 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
BRD3Q15059 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
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