Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.44□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
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COL19A1Q14993 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
COL19A1Q14993 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC5.43□□□□□ -1.54
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