Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC007742.2-201ENST00000618226 398 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
SEMA3AQ14563 ERBIN-214ENST00000511297 4257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 RNF180-202ENST00000389100 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 Z99127.3-201ENST00000448158 395 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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SEMA3AQ14563 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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SEMA3AQ14563 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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SEMA3AQ14563 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
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SEMA3AQ14563 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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SEMA3AQ14563 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
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SEMA3AQ14563 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
SEMA3AQ14563 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
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