Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 MTCO3P19-201ENST00000415864 321 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RN7SL459P-201ENST00000481078 302 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
COL9A3Q14050 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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