Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC073530.1-202ENST00000538008 508 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC110741.2-201ENST00000605278 268 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AP002360.3-201ENST00000607673 710 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 DAZ4-206ENST00000449750 3271 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
ATP1A4Q13733 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 FABP3P2-201ENST00000453169 399 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
ATP1A4Q13733 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
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