Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
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TOP3AQ13472 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
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