Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RN7SL834P-201ENST00000461450 286 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 MTND6P8-201ENST00000503471 522 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AL591767.3-201ENST00000554632 525 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 ZNF254-206ENST00000611359 3982 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 SP110-202ENST00000258382 2080 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 CTNNA1P1-201ENST00000515849 2728 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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MKRN4PQ13434 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 SPEF2-202ENST00000356031 5681 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 KIF13A-205ENST00000378843 5707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 PEX13-201ENST00000295030 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 SYTL4-203ENST00000372981 4847 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 LINC01087-201ENST00000431979 3516 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 LRRC31-202ENST00000316428 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 IGF2BP3-201ENST00000258729 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AP003486.1-201ENST00000525716 3994 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
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MKRN4PQ13434 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
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MKRN4PQ13434 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
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MKRN4PQ13434 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 ZNF559-ZNF177-203ENST00000541595 2435 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 AC093278.2-201ENST00000564956 2485 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
MKRN4PQ13434 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
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