Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AL138799.2-201ENST00000439024 343 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AL360089.1-201ENST00000442260 436 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
SEMA3BQ13214 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.5 ms