Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 C16orf97-205ENST00000568524 406 ntTSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.13□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 CEACAM1-203ENST00000352591 3170 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 ZBTB8B-201ENST00000609129 12834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RAD51B-210ENST00000487270 2596 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC004889.1-208ENST00000489077 423 ntTSL 3 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RASGRF1-201ENST00000394745 2850 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC7.12□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 ATMIN-204ENST00000564241 4803 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 PLEKHH2-201ENST00000282406 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 RAB9B-201ENST00000243298 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 GUCY1B2-204ENST00000531898 1979 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
MKRN3Q13064 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
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