Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 RPS3AP54-201ENST00000435535 734 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC023575.1-201ENST00000580510 358 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 GSTM1-206ENST00000483399 512 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 ZNF429-209ENST00000618549 1889 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
EFEMP1Q12805 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
EFEMP1Q12805 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
EFEMP1Q12805 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
EFEMP1Q12805 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
EFEMP1Q12805 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
EFEMP1Q12805 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
EFEMP1Q12805 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
EFEMP1Q12805 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
EFEMP1Q12805 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EFEMP1Q12805 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.2 ms