Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 PCBP2P3-201ENST00000509726 843 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AC037487.2-201ENST00000581796 537 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AC112191.3-201ENST00000604371 277 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
ANKRD28O15084 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 AC104777.3-201ENST00000416350 545 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 AC011451.2-201ENST00000604303 598 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
ANKRD28O15084 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms