Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC009139.2-201ENST00000569032 566 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
J3KRW8 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AL591848.1-201ENST00000413092 322 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AL022329.2-201ENST00000413494 660 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC3.47□□□□□ -1.85
J3KRW8 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
J3KRW8 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.85
J3KRW8 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.85
J3KRW8 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
J3KRW8 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
J3KRW8 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms