Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD26

GOPC, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOPCQ9HD26 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 RFC1-202ENST00000381897 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 TRAPPC6B-201ENST00000330149 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 ARHGAP5-206ENST00000539826 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 MID2-202ENST00000443968 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 RNU6-14P-201ENST00000384630 106 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 BNIP3P5-201ENST00000562290 498 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 MIR765-201ENST00000390226 114 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 RPS27P18-201ENST00000431701 247 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AC108145.1-201ENST00000503770 153 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 DOCK10-202ENST00000409592 7288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
GOPCQ9HD26 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.2 ms