Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 AC013562.2-201ENST00000611632 603 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SMG1Q96Q15 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 USP9YP15-201ENST00000442391 422 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC1.57□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 TWF1-207ENST00000548315 1170 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
SMG1Q96Q15 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
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