Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 KLHL2P1-201ENST00000508691 521 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
TRAPPC9Q96Q05 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms