Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC008837.1-201ENST00000511513 412 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 NUTF2P8-201ENST00000604593 363 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC112503.2-201ENST00000609005 552 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AL450344.2-201ENST00000455229 614 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
ZBED3Q96IU2 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
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