Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC026780.1-201ENST00000512237 952 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AP001646.3-201ENST00000526305 446 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 MTCYBP42-201ENST00000444653 1130 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
C9orf135Q5VTT2 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.68□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms