Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ZBTB20-AS2-201ENST00000478301 372 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC092017.3-201ENST00000638880 536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RPS3AP3-201ENST00000411933 242 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL591212.2-201ENST00000433923 257 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 MMP13-203ENST00000615555 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 CFHR3-205ENST00000471440 1965 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 PNPT1P2-201ENST00000456768 2050 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CCDC142Q17RM4 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CCDC142Q17RM4 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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