Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC093025.1-201ENST00000547795 569 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC006023.2-201ENST00000609916 167 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC010460.2-201ENST00000509054 677 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 SCARNA1-201ENST00000517138 166 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 PKIB-201ENST00000258014 1595 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
NRF1Q16656 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms