Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL022401.1-201ENST00000619498 108 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 OR2A7-202ENST00000641841 2062 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 PROM1-220ENST00000540805 3908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC000111.2-201ENST00000448200 210 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 ADGRL3-217ENST00000514591 6297 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
ECM1Q16610 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
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