Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC092326.2-201ENST00000624772 1561 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
NTRK3Q16288 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 USP44-208ENST00000552440 1818 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
NTRK3Q16288 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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