Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL451044.1-201ENST00000604867 238 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
CNGA3Q16281 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
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CNGA3Q16281 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
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CNGA3Q16281 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 NPM1P49-201ENST00000448027 714 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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CNGA3Q16281 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
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CNGA3Q16281 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
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CNGA3Q16281 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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CNGA3Q16281 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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CNGA3Q16281 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
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CNGA3Q16281 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
CNGA3Q16281 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
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