Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 LINC02493-201ENST00000509964 1704 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 HMGN1P14-201ENST00000412459 517 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AL669831.4-202ENST00000590817 238 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
VPS72Q15906 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 TRIQK-209ENST00000519969 555 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
VPS72Q15906 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms