Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC091117.1-201ENST00000560967 426 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AP005230.1-201ENST00000585072 675 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 UGT2A2-201ENST00000604021 1544 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC092642.1-201ENST00000392417 425 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 FAM204CP-201ENST00000424489 642 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC011396.1-201ENST00000507391 312 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC104619.2-201ENST00000514293 646 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 BTF3P12-201ENST00000519620 469 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
VAMP3Q15836 SAMD9-201ENST00000379958 6852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RRM2B-203ENST00000395912 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
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