Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AF129075.1-201ENST00000457162 794 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 SYPL1P1-201ENST00000473622 768 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC007285.2-201ENST00000433088 518 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC004854.1-201ENST00000440356 349 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.93
GPNMBQ14956 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
GPNMBQ14956 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms