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| BECN1 | Q14457 | RNU6-359P-201 | ENST00000365466 | 108 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | PLG-203 | ENST00000366924 | 1166 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNU6-157P-201 | ENST00000383957 | 107 nt | BASIC | 3.8 | □□□□□ -1.8 | | |
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| BECN1 | Q14457 | AC118273.1-201 | ENST00000525324 | 3006 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | OXR1-206 | ENST00000449762 | 2621 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC090740.1-201 | ENST00000623193 | 2262 nt | BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | LCA5L-218 | ENST00000485895 | 2551 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.79 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | POLK-217 | ENST00000515295 | 1438 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | OR8D1-201 | ENST00000357821 | 1026 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNU4-35P-201 | ENST00000362588 | 141 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | RNU6-97P-201 | ENST00000363387 | 104 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | MIR135A2-201 | ENST00000384854 | 100 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | TRAV7-201 | ENST00000390429 | 337 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | LINC01934-201 | ENST00000414750 | 391 nt | TSL 3 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC093865.1-201 | ENST00000415387 | 433 nt | TSL 3 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | MTCO2P21-201 | ENST00000419780 | 677 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | LINC02238-201 | ENST00000424953 | 557 nt | TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | AL138900.2-201 | ENST00000434098 | 156 nt | TSL 3 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC092155.1-201 | ENST00000444672 | 573 nt | TSL 4 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | RAC1P7-201 | ENST00000445367 | 377 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | MTND1P9-201 | ENST00000453775 | 944 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC104308.1-201 | ENST00000454621 | 333 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | AC067945.3-201 | ENST00000456176 | 386 nt | TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | ARPC3P2-201 | ENST00000457786 | 533 nt | BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |
| BECN1 | Q14457 | PDCD10-206 | ENST00000470131 | 1026 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 3.78 | □□□□□ -1.8 | | |